足背腱鞘囊肿经常发生于足背动脉的外侧，趾长伸肌腱鞘的旁边。常见的鉴别诊断的浅表肿瘤是皮样囊肿、腱鞘巨细胞瘤、脂肪瘤、纤维瘤等等，其中最简单、最快捷的鉴别方法是彩色超声，往往都可以比较明确的诊断腱鞘囊肿。皮样囊肿的病人，一般会有明确的外伤史，腱鞘巨细胞瘤的质地比腱鞘囊肿要硬。

脂肪瘤的界限摸起来比腱鞘囊肿更加广泛，没有那么清晰，质地比腱鞘囊肿要柔软。纤维瘤往往体积没那么大，质地也比较硬。类风湿性结节增生通过拍片子，就可以进行初步的鉴别诊断。