肺炎支原体、衣原体抗体阴性说明病人没有合并这两种病原体，导致肺炎感染的主要病原体包括细菌、病毒、支原体、衣原体、真菌等，可以通过血常规、病毒检测、支原体或衣原体抗体检测、真菌β-D-葡聚糖检测来明确病人存在哪种感染，最简单、直接的手段还是根据病人的临床症状以及肺部的影像学变化来进行判断。

明确病原体以后，在治疗上就需要选择针对病原体的药物来控制感染，同时针对病人的临床症状选择对应的治疗方式。