Ⅰ型和Ⅱ型呼吸衰竭的治疗包括病因的治疗，只有改善和控制引起呼吸衰竭的病因，才能使呼吸衰竭得到有效的缓解。

Ⅰ型呼吸衰竭的患者在病因治疗的同时要予以适当的氧疗，因为此时患者多伴有严重的低氧血症，可以予以鼻导管吸氧或面罩吸氧，以尽快的速度改善患者缺氧的状态，通常需要高浓度吸氧，部分患者还可以予以呼吸机的辅助呼吸治疗。

而针对Ⅱ型呼吸衰竭要改善患者的通气功能，改善肺泡的有效通气量，改善患者二氧化碳潴留的现象，此时多需要予以解痉、平喘，部分患者还需要糖皮质激素的治疗。患者的氧疗多需要低浓度吸氧，避免高浓度吸氧，还可以予以呼吸机的辅助呼吸等治疗。