自闭症主要是遗传因素引起的，同时也有一定的环境因素作为影响因素。但是自闭症作为儿童期比较严重的精神疾病，最主要的原因是遗传因素引起的，比如有可能伴随着多基因遗传问题或者是基因突变问题。

从统计学角度，如果家庭中尤其是三代以内的直系亲属有自闭症、焦虑症的问题，或者是三代以内的旁系亲属有自闭症的问题，患儿出现自闭症的概率大大增加，可能是普通人的几倍到十几倍，从这个角度自闭症由于遗传因素引起来的可能性很大。