口腔溃疡和手足口病在发病原因、临床表现、治疗以及预后方面都有非常大的区别。首先，口腔溃疡病因不清，是发生在口腔黏膜上的一种溃疡类疾病，与细菌感染和病毒感染关系不大。但是手足口病主要发生在5岁以下的儿童，口腔、手、足表面出现病毒性感染，经常是胃肠道病毒、柯萨奇病毒感染所引起。

在临床表现上，口腔溃疡一般存在明显的红、黄、凹、痛临床症状，而手足口病发生在口腔内的时候，会在口腔黏膜以及硬鄂出现小的水疱，破溃，在手、足、臀腿部会出现斑丘疹，随后形成小的水疱。

在治疗上，口腔溃疡一般不需要治疗，半个月会自动愈合，也可以喷一些开喉剑喷雾剂，促进愈合。手足口病由于非常容易引起继发感染，出现脑膜炎等，一定要早期采取治疗措施。手足口病是具有传染性的疾病，首先需要对患儿进行隔离，其次需要对症治疗，对于口腔内的疱疹和溃疡需要进行消毒、喷药进行治疗，最后，手足口病还需要尽早采取中药清热解毒治疗。

在预后上，口腔溃疡本身是具有复发性和自愈性的疾病，预后较好，不会出现明显的后遗症。但是手足口病是病毒感染性疾病，病情发展迅速的，可以在1周左右就出现脑膜炎，甚至出现肺水肿，一定要尽早采取治疗措施，如果症状轻，一般会在1周左右自愈。