HPV通常是通过局部病灶分泌物检查，来完成检查的，常可以通过宫颈管、阴道、外阴病灶，或者喉部分泌物检查来完成检查。通常HPV检查，主要用于女性宫颈疾病的筛查，主要检查操作方法，是在非经期，通过标本刷深入宫颈管，顺时针或者逆时针向同一方向旋转6-8圈，然后取出标本刷，存放于保存的试剂瓶内送去化验。

为了确保检查的准确性，检查前需要暂停性生活1周，需要在无阴道炎、分泌物少的情况下进行。临床上主要通过HPV检查，来判断女性是否有宫颈病变的高危因素，所以，HPV检查是女性筛查宫颈癌的一项重要检查，主要用于已婚女性的宫颈疾病筛查。