卵巢巧克力囊肿微创手术的费用大概是在14000块钱左右，建议最好是在月经完全干净3-7天内来做该项手术。由于医院的级别不同，所以收费标准也不一样，这个是三甲医院的收费标准，建议做手术之前做相应的咨询，二甲医院相对会收费比较低一些。而且这个费用不包括住院之前门诊的检查费用，也不包括出院以后再复查以及继续治疗的费用，建议弄清楚之后，尽快给予做手术进行治疗。

巧克力囊肿本身会有复发的可能性，所以在术后一定要给予继续治疗，并且要定期的给予复查，每半年做一次B超检查。