女性如果发生宫外孕，采用药物保守治疗，主要会发生以下几方面的危害：

1、宫外孕保守治疗主要是通过服用甲氨蝶呤药物，导致胚胎发生死亡，这种药物孕妇服用后，对身体副作用比较大，药物在导致胚胎死亡的过程中，同样会杀死自己身体内正常的细胞，影响孕妇身体健康。

2、孕妇发生宫外孕如果采用保守治疗，服用药物后，吸收后导致胚胎死亡需要一个过程，不会马上出现死亡，所以在这个过程中，如果胚胎组织发育比较大，导致输卵管破裂，容易引起大出血现象。宫外孕大出血属于急腹症，如果得不到及时手术治疗，非常容易导致孕妇出现生命危险，所以危害相当严重。