结石纳肛止痛药物有吲哚美辛栓或双氯芬酸钠栓剂治疗。直肠黏膜也有一定的吸收作用，药物进入直肠黏膜后，吸收入血可以起到止痛的作用，与口服吸收类似，但目前结石止痛的药物除外栓剂药物，尚有口服及肌肉注射药物，起效也较快，且无需纳肛，减少患者纳肛带来的疼痛。

口服药物可选用吲哚美辛5mg，每日三次；双氯芬酸钠胶囊一粒，每日一次。如疼痛较为剧烈，可选择肌肉注射针剂，但需要医生处方才可以使用。常用的制剂可选用盐酸布桂嗪注射液100mg肌注或杜冷丁注射液50mg肌肉注射，也可起到立即缓解结石疼痛的作用。