毛囊炎和梅毒的区别，在于以下几个方面：

一、病因方面，毛囊炎多由于机体免疫力下降，痤疮丙酸杆菌、表皮葡萄球菌、白色葡萄球菌等细菌感染引起的炎症反应，梅毒是由于不洁性生活导致梅毒螺旋体感染，引起的性传播疾病。

二、皮疹形态，毛囊炎可以出现毛囊炎性丘疹、脓疱、粉刺等表现，梅毒在二期时可以出现毛囊炎性的皮疹，也可以出现类似寻常型银屑病或者玫瑰糠疹形态的皮疹。

三、治疗，毛囊炎可以外用克林霉素磷酸酯凝胶，口服盐酸米诺环素胶囊，梅毒需要肌注苄星青霉素注射液治疗。