在临床上，婴儿肠梗阻的治疗要根据病因采取相应的措施。

如果婴儿是因为肠旋转不良所导致的肠梗阻，需要进行手术治疗，手术的时候应该按照反时针方向进行肠复位，要注意观察肠管的血运以及肠再灌注损伤。另外，术中的时候要常规切除阑尾，注意纠正合并其他的畸形。如果患者是因为先天性巨结肠所导致的肠梗阻，一般先用保守治疗的办法。在麻醉下用扩张器扩肛以后，每周两次进行扩肛治疗，可以锻炼患者排便。另外，如果患者病情严重，要做结肠造瘘术，以后还要做根治性的手术治疗。如果患者是因为肠套叠所导致的肠梗阻，需要进行空气灌肠，因为空气灌肠是治疗肠套叠的主要治疗手段。

一般婴儿肠梗阻只要救治及时，患者的预后都是良好的。