肾囊肿在锻炼后一般是不会消失的，肾囊肿可分为先天性的肾囊肿和后天性的肾囊肿两种类型。

先天性的肾囊肿是一种遗传性的疾病，所以并不会随着锻炼而消失。而后天性的肾囊肿一般来说也不会随着锻炼消失，有些患者的囊肿可能会稳定在一定大小，也有些患者可能存在逐渐增大的趋势。肾囊肿如果锻炼后出现消失，有可能是因为剧烈运动以后导致肾囊肿破裂。

患者可通过适当运动，预防发生泌尿系结石，但是尽量避免进行较为激烈的爆发性运动，如短跑、俯卧撑、肌肉耐力训练等，以防止肾囊肿发生破裂、出血，甚至继发肾脏感染。

对于后天性的肾囊肿来说，尤其是单个的肾囊肿，并不影响肾脏的功能。因此，得了肾囊肿以后并不需要特殊治疗，除非囊肿大于4cm时产生了压迫症状，如患者出现了腰痛、腰酸等症状，或者囊肿特别巨大，超过10cm则需要积极配合医生进行治疗。

囊肿直径超过4cm时，可能会压迫到周围组织，可考虑进行囊液抽吸术或是在腹腔镜下将囊肿切除，建议囊肿直径超过10cm的患者及时进行肾囊肿切除术，一般预后较为理想，疼痛症状也能得到有效缓解。