卵巢囊肿和宫颈囊肿不一样，首先发生的部位不一样。卵巢囊肿是长在卵巢上，而宫颈囊肿是长在宫颈上，宫颈属于子宫的一部分。再者，两者的性质也不一样，卵巢囊肿可以分为生理性囊肿和病理性囊肿。所谓生理性囊肿就是常见的卵泡囊肿或者滤泡囊肿。经过2-3个月的观察治疗之后，再次复查超声可能已经自动消失。

病理性囊肿是长期存在的，而且有时可能伴有临床症状。而宫颈囊肿是慢性宫颈炎的一种表现，大部分是通过超声检查发现。妇科检查时宫颈外观可以正常，或者看到表面凸起的囊泡样的改变。