慢性萎缩性胃炎患者可以吃奥美拉唑治疗，不过需要慎重用药，必须在消化专科医生的指导下才可以使用该药。因为奥美拉唑属于抑制胃酸分泌的药物，包括其他的质子泵抑制剂，如兰索拉唑、雷贝拉唑，或者H2受体拮抗剂，如雷尼替丁、尼扎替丁等均属于抑酸的药。

对于慢性萎缩性胃炎患者，如果长期使用该药，有可能会导致胃黏膜萎缩加重，从而会引起萎缩性胃炎进一步发展，有可能会演变成胃癌。药物治疗上主要是以胃黏膜保护剂治疗为主，如硫糖铝、铋剂或者保护胃黏膜的中成药。

治疗的关键在于密切随访，要遵照医嘱定期复查，查电子胃镜和病理检查等，如果病理明确存在胃黏膜中度不典型增生，则需要行预防性手术治疗。