柠檬内富含柠檬酸，可以抑制体内结石形成，所以经常食用柠檬或者饮用柠檬水可以预防结石形成，其原理是增加柠檬酸的含量，抑制结石，形成相关的结晶成分或者结石前体。饮用柠檬水以后还可以增加体内的体液含量，稀释尿液，以免尿液中的成分增多，而导致结石、结晶前体形成。

对于已经患有泌尿系统结石的患者，适当多饮用柠檬水可以增加尿量，促进结石排出，同时可以预防结石体积进一步增大，但需要配合体外冲击波碎石或者配合其他的药物辅助治疗，或者作为一种手术，术后多饮水、多排尿，促进结石排出的一种辅助治疗。对于未患有泌尿系统结石的患者，经常饮用柠檬水或者食用柠檬等可以增加体内柠檬酸的含量，减少结石发生的概率。