三个月的宝宝如果出现消化不良拉肚子：

首先可以给宝宝进行腹部按摩来缓解宝宝的肠胀气，促进肠蠕动以及肠绞痛的发生，或者进行推拿。

另外可以给宝宝口服益生菌来调节肠道菌，口服健脾胃的中成药。

如果大便很稀，可以口服蒙脱石散，让大便干起来。如果拉肚子时间长应该进行大便常规化验，来排除有没有发生细菌感染，如果有细菌感染需要口服抗生素进行治疗。如果是吃母乳的宝宝，妈妈应该清淡饮食，避免吃高油以及高糖的食物。如果是吃配方奶的宝宝拉肚子时间很长，应该换成腹泻奶粉，腹泻奶粉不含乳糖，可以缩短拉肚子的病程。