肾囊肿钙化的治疗方案需要根据肾囊肿大小而定。如果肾囊肿较小且肾功能正常，定期做泌尿系彩超或者泌尿系CT，观察囊肿大小及肾功能情况即可，不需要进行特殊治疗。

因为任何药物不能使肾囊肿减小或者使钙化消除，如果肾囊肿钙化且肾囊肿大于4cm，如果不及时治疗可能会恶变、出血、感染、破裂、压迫引起肾盂积水或肾功能异常的发生，同时容易引起腰部酸胀不适，可以进行手术减压的治疗，从而减轻肾功能损害。