并不是所有的大三阳都需要临床治疗，对于只是乙肝病毒携带者的大三阳患者，由于乙肝病毒DNA定量和肝功能正常，也没有明显的临床症状和肝脏组织形态学的改变，因此可以定期密切随访观察，但是在日常生活中还是应当注意避免饮酒、避免进食油腻食物、避免熬夜和过度劳累。而对于肝炎活动期的大三阳患者需要给予及时的处理，由于病毒DNA定量和转氨酶会出现明显的升高，因此需要给予及时的抗病毒和保肝药物应用。

前者常用的药物有恩替卡韦、阿德福韦酯，而后者常用的药物包括复方甘草酸苷、还原型谷胱甘肽等。如果治疗恰当、时机合适，乙肝大三阳的患者甚至有可能转阴。但是由于乙肝容易出现反复发作，即使治疗获得较好的缓解，也应当注意密切随访观察。如果大三阳引起肝硬化、门静脉高压、肝功能衰竭、原发性肝癌，还需要针对并发症进行处理，甚至有可能需要进行手术治疗，比如肝癌切除、肝移植等。