隐球菌肺炎是由新型隐球菌引起的亚急性或慢性深部真菌病，主要侵犯中枢神经系统和肺，常发生于化疗、应用大剂量激素或者恶性肿瘤等免疫功能低下的患者。隐球菌的治疗分以下两个方面：

一、药物治疗，可以根据隐球菌肺炎患者免疫功能状态的不同，而选用不同的药物。首选药物为两性霉素B，推荐与氟胞嘧啶及其他抗真菌药物联合应用，其他抗真菌药物可以应用氟康唑。

二、手术治疗，仅限于局限性病灶，比如皮肤、胸部或肺部的肉芽肿性病变、脓肿、空洞等病变，在未侵及中枢神经系统的情况下可以采取手术局部切除。