手足口病一般是由肠道病毒感染引起的急性传染病，在我国最为常见的主要是柯萨奇病毒A组16型和肠道病毒71型。肠道病毒属RNA病毒的微小RNA病毒科，该类病毒对外界有比较强的抵抗能力，在40℃的环境下可以存活一年。因为病毒中没有脂质，所以对氯仿等消毒剂不是很敏感。但是这个病毒不耐强碱，且对紫外线及干燥比较敏感，高锰酸钾、漂白粉、甲醛、碘酒等等都能使它灭活。

手足口主要是感染3-6岁上幼儿园的儿童，6岁以上的儿童一般比较少见。每年的高发季节是在孩子上学的时间（2-6月，9-11月）。