对于治疗急性骨髓炎的首选药物是以消炎药为主，对于急性骨髓炎要足量联合应用抗生素进行治疗，最好取分泌物做细菌培养和药敏试验。根据培养检查结果和药敏实验结果，选用有效的抗生素进行控制感染，比如头孢类的头孢克肟、喹诺酮类的氧氟沙星。

另外对于骨髓炎比较严重的，还需要积极的进行穿刺吸液反复的冲洗。如果比较严重的可能需要彻底的清创，或者截肢手术进行治疗。还有就是万古霉素，万古霉素对金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肠球菌有很强的作用，之后就是克林霉素。另外如果怀疑其他的，比如革兰阴性菌感染可以应用利福平，还可以应用氨基糖苷类的抗生素。