肛瘘如果不通过手术治疗，很难自行愈合，即使短期内自行愈合，也会出现复发的现象。因为肛瘘主要是直肠通过肛周，有一个通道通向肛周皮肤，这是异常的通道，而且会有大便分泌物以及粪便经窦道流出，导致不断的反复感染情况发生，尤其是在上火、劳累的时候，还有辛辣刺激饮食、大量饮酒之后很容易复发。

所以如果发现了肛瘘，建议及时手术治疗，具体手术的方式建议到正规专科医院系统检查。复杂的肛瘘需要多次手术治疗，高位肛瘘需要挂线疗法。如果是低位肛瘘，通过局部的窦道切除术就可以。