脊柱裂是存在一定遗传性的，相关研究证实，如果既往有一个脊髓脊膜膨出生育史者，发病率会增加至2%-3%；有两个为6%-8%。如果家族近亲，比如兄弟姐妹中有脊髓脊膜膨出生育史，发病风险也会增加，尤其是母系亲属。

因为脊髓脊膜膨出属于脊柱裂的一种类型，因此脊柱裂是具有遗传性的。同时战争、饥荒和经济困难期发病率也会增加，但战后发病率逐渐降低。遗传遵循非孟德尔遗传法则，可能为多因素致病，产前补充叶酸能够降低脊柱裂的遗传性。