脑干出血发热的原因如下：

1、部分患者发病后很快会发热，通常这种发热叫中枢性高热，一般采用物理降温对症处理；

2、脑干出血发热可能来源于其并发症，例如严重的吸入性肺炎，误吸导致肺部感染，或者泌尿系感染等感染性因素。如果是肺部感染或者泌尿系统感染，主要针对病原菌，进行相应的抗生素对症治疗。对于中枢性高热，主要通过冰毯等物理性治疗为主。