结石发生在上尿路或者下尿路，导致肾绞痛主要的病因是输尿管痉挛。血液通过肾动脉进入肾脏，经过肾小球和肾小管的过滤作用，形成尿液，营养物质被人体重吸收，其中废物通过尿液形式排出体外，例如肌酐、尿素氮。

部分沉淀物质如尿酸盐，结晶沉淀后会逐渐扩大，导致结石形成。结石随尿液的形成和排出，向下移动，在移动过程中引发肾绞痛。