颅底脊索瘤平均寿命大约为6.3年左右，如果患者不进行任何治疗，平均寿命大约半年到2年之间，因此，对于颅底脊索瘤的患者需要早期进行医学干预。因为脊索瘤预后不是太好，早期通过积极合理的治疗可以提高生存率。

目前对于脊索瘤主张手术切除，加放射治疗为主，对于进行过手术和放疗的病人，如果手术切除不彻底，5年内复发率可以高达100%。如果手术切除彻底，复发率仍可以高达80%。所以，对于脊索瘤手术之后的病人，一定需要强调定期随访，可以早期发现存在的复发病变，早期再次进行医学干预，提高患者的生存率。