肛窦炎用药如下：

1、口服药物治疗。内服药抗感染和防止便秘，肛窦炎大多为大肠杆菌感染，可给予相应的抗感染药物，如甲硝唑、氟哌酸、青霉素等，通便给予缓泻药乳果糖、麻仁丸及番泻叶等。

2、熏洗坐浴治疗。用清热利湿、解毒消肿的中草药，如黄芩、黄柏、黄连、金银花、五倍子等煎汁先熏后洗或1:5000高锰酸钾熏洗。

3、外用药物治疗。每次坐浴熏洗后肛内可纳入普及痔疮栓等，并将抗菌消炎药膏，如红霉素软膏敷于发炎的肛窦表面。