肛周脓肿如果不开刀，也可以选择保守的抗感染治疗，通常需要应用头孢类或者联合甲硝唑类的消炎药物。但是肛周脓肿这个疾病如果治疗延误或者没有得到有效的治疗，很容易并发肛瘘的形成。

肛瘘属于肛周脓肿的慢性期表现，而肛周脓肿最有效的治疗办法还是选择手术进行切开引流。因为发生原因都是由于肛窦的炎症反复不愈而导致的，容易在局部形成脓肿，并且对于有基础疾病的病人，包括糖尿病、机体免疫力低下的患者，很容易继发肛周软组织的感染，而单纯的保守治疗可能会导致脓肿的局限。当机体免疫力低下的时候，还会诱发脓肿的再发，反复的不愈，最终都会导致肛瘘的形成，会给病人增加很多不必要的痛苦。