拉肚子对肛瘘有一定的影响，因为患者腹泻时的大便为稀水样，容易从肛瘘内口进入瘘管，而引发瘘管内出现感染，导致肛瘘急性发作或者出现局部肿痛、流脓的症状。如果肛瘘外口已经闭合，会出现类似于肛周脓肿的症状。

如果脓肿经原外口破溃流出，就会导致症状缓解。但如果脓肿不经原外口破溃流出，而另开通道流出，就会将原来单纯性肛瘘变成复杂性肛瘘，增加后期治疗的难度，也会导致局部感染的范围扩大，严重的会影响患者的肛门功能。