肛肠疾病有很多种，甚至有几十种，但是总的来说分为四大类：
包括痔、瘘、裂等常见病。
比如便秘或者是肠易激综合征。
这类疾病包括结直肠炎、克罗恩疾病或者是结核性肠炎。
比如结肠癌、直肠癌。
总之，这四类疾病当中又分出很多疾病。因此肛肠疾病其实包括的种类很多，从部位上来说，可以包括整个结肠、直肠和肛门等部位所发生的疾病都可以纳入肛肠疾病。肛肠疾病的从字面上理解，就知道肛门和结直肠等部位所发生的疾病都可以称之为肛肠疾病。
目前，医院在分科上分有肛肠科。所谓肛肠科是包括肛门、直肠、乙状结肠所发生的疾病，这类疾病都可以纳入肛肠疾病。以前一般老百姓所说的痔瘘科，其实也是肛肠疾病的范围之内，但仅仅是肛肠疾病的一部分，也是肛肠疾病部分常见病。除了常见的肛肠疾病，还包括刚才所说的结直肠炎性疾病、结直肠的肿瘤或者结直肠的功能性疾病，这四类合在一起，才是一个完整的肛肠科所含纳的疾病范畴。