新生儿肺动脉高压治疗主要分为以下几个方面：

1、建立正常通气，纠正缺氧：因为它是肺血管适应不良导致，所以首先要建立正常通气，把缺氧纠正过来，使得痉挛的肺血管会慢慢好转；

2、药物控制肺动脉压力：常见药物有一氧化碳吸入、西地那非、米力农等；

3、升高体循环压力：因为肺动脉高压容易导致体循环压力降低，然后会导致分流。所以要上升体循环压力升，需要进行相应的处理，比如用血管活性药物上升体循环压力，避免肺动脉的血回流到主动脉里，导致临床改变。

此外，肺动脉高压的原因有很多，要针对不同的原因进行相应的处理，比如根据每个小孩子具体的情况，不断进行评估，然后作出相应处理。