小儿疱疹性口腔炎是由单纯疱疗病毒感染引起来的，所以一般的病程是1-2周。要保持口腔的清洁，多饮水，食物以微凉或者凉的流质为宜，要避免刺激性的食物，局部可以涂疱疹净抑制病毒，也可以喷洒西瓜霜、锡类散等。

为预防感染，可以涂2.5%-5%的金霉素鱼肝油，疼痛严重的可以在餐前用2%的利多卡因涂抹局部。发烧的时候可以用退热剂，可以行全身的抗病毒治疗，抗生素并不能缩短疱疹性口腔炎的病程，仅仅适用有继发感染的宝宝。疱疹性口腔炎所属的淋巴结经常会肿大、有压痛，一般持续2-3周时间。