颅内生殖细胞瘤通常分为生殖性生殖细胞瘤和非生殖性生殖细胞瘤。对于愈后较好的生殖性生殖细胞瘤，五年的存活率达到90%以上，即大部分生殖细胞瘤患儿可以治愈，且不会复发。部分患者可能有约20%-30%的复发率。

治愈包括生理上的治愈和心理上的回归。对于生理上的治愈，大部分生殖细胞瘤可以治愈。但生殖细胞瘤好发于青少年，对于患儿和青年人而言，生理治愈以后的心理回归和社会的功能的恢复尤为重要。