胆总管囊肿在临床上相对比较少见，不过应当及时采取手术治疗，手术的方式主要是采取囊肿切除以及胆肠吻合术。部分胆总管囊肿术后的患者不仅生活质量良好，而且生存期也非常满意，可以获得长期生存，比如存活20年、30年，甚至接近正常人群的生存年限。但也有部分胆总管囊肿术后的患者，由于反复的消化液和食物残渣的刺激，最终会导致胆总管内结石形成，还会引起反复发作的胆管炎，甚至最终会造成胆管癌的发生。

这些不仅会影响患者的生活质量，还会严重影响患者的生存期。胆管癌是恶性程度非常高的消化系统肿瘤，即使进行手术治疗，五年生存率也可能不超过30%，很多患者有可能在1-2年内出现死亡。