经阴道超声采用的探头频率高、分辨率好，距盆腔器官近，无需膀胱充盈，不受肥胖及气体的干扰，比经腹部超声更容易显示子宫内膜及卵巢病变的微细结构。经阴道超声作为一项无创的检查方法，操作简便可重复性强，已成为妇科疾病辅助诊断的重要检查方法，对于大部分子宫病变如子宫肌瘤、典型的子宫腺肌症、子宫畸形、内膜息肉样病变、宫腔粘连、宫内节育器以及典型的子宫恶性病变、卵巢病变等可提示倾向性的诊断意见。

对于不典型病变需要结合临床表现、实验室检查方法或其他的影像学方法进一步帮助诊断，其局限性是对于没有性生活史以及有阴道畸形和急性阴道炎，月经期间的女性不宜进行经阴道超声检查，经阴道超声扫查的深度一般为8-10cm，对于较大的盆腔肿物难以显示其全貌，或与邻近脏器的关系。这时候经腹超声与经阴道超声联合扫查，就能够得到更满意的结果。