血清甲胎蛋白检测主要用于诊断肝癌。肝癌的发生率是越来越升高，早期诊断肝癌除了抽血化验血清甲胎蛋白，还有影像学检查，就是肝脏彩超检查或者肝脏CT检查。当血清甲胎蛋白明显升高的时候，要高度重视肝癌的发生。

肝癌的发生人群常常是有肝癌家族病史、长期大量饮酒或者有慢性乙型肝炎病史的人，慢性乙型肝炎有慢性乙型肝炎、肝硬化、肝癌的三部曲现象。血清甲胎蛋白检测也可以用于诊断慢性肝炎或者肝硬化的情况。