若手术顺利，腭裂的手术费用约为10000-12000元。包括5000-6000元以上的麻醉费用，以及检查费用、药费等。但不包括术后发生出血，进行二次手术，或者存在感染，需较长时间抗生素治疗的费用。腭裂手术属于医保范围。

另外一些慈善组织，如最大的世界性唇腭裂慈善组织，微笑列车，还有一些其他组织，也可对患者提供资助。