扁桃体肿大引起的咳嗽，主要是因为扁桃体异常的肿大而接触刺激咽后壁或者舌根部导致的异物感而引起的咳嗽，咽部不适。它的治疗方案首先还是以缓解咽腔黏膜不适感，咳嗽为主，可口服蓝芩口服液、五味麝香丸、银黄含化片以及中草药金银花、胖大海、麦冬、陈皮等等代茶饮。

如果扁桃体肿大，伴随有睡眠打鼾及憋气的情况，以及常年反复的扁桃体发炎感染，这时临床上还是建议以手术切除扁桃体治疗为主要方案。