甲状腺的疾病选择细针穿刺也有一定的危害，在手术穿刺过程当中容易出现并发症，常见的是恶性肿瘤病人通过穿刺，容易导致肿瘤细胞的种植转移，也是一种严重的并发症。

有一些患者在穿刺过程当中，容易出现副损伤，常见的就是腺体损伤会导致出血，血管损伤容易继发出现出血。神经损伤病人会出现疼痛、麻木，甚至还会表现为发音异常，在穿刺过程当中最好在彩色超声指引之下，能够明显的降低并发症发生的几率。

有一些患者容易出现穿刺之后局部的炎症反应，也就是出现了感染，可以通过口服消炎药的方法治疗。但是，总的来说甲状腺细针穿刺是明确甲状腺结节性质的必要手段，对于有经验的医生来说，总体风险还是较小的。