如果上厕所时突然晕厥，主要考虑迷走神经性的晕厥，这种情况属于反射性晕厥的一种类型，患者在夜间上厕所的过程中可能会有迷走神经兴奋，会导致患者出现血管的扩张，引起心率减慢、血压下降，会引起患者的大脑供血显著减少。

所以患者会出现突然的晕厥发作、一过性的意识丧失，严重的时候患者可能会伴有大小便失禁等症状，这种情况一般在患者长时间站立、咳嗽、排尿的情况下容易诱发，但是一般不会有明显的后遗症，患者在短时间内就可以迅速清醒。但是这类患者平时一定要注意防护，避免因为跌倒导致身体出现不必要的损伤。