完全心内膜垫缺损分型为部分型，包括过渡型和完全型心内膜缺损。部分型包括原发型房间隔缺损及二尖瓣瓣裂，这种类型下的二尖瓣、三尖瓣的瓣环基本是完整，只是有小裂隙，导致二尖瓣关闭不全，左心室收缩时血液会反向流向左心房，不合并室间隔缺损。过渡型包括原发型房间膈缺损、分裂二尖瓣和较小的室间隔缺损，室间隔缺损位于心室的流入道部分，但此时二尖瓣、三尖瓣仍是分开。

完全型有原发型房间隔缺损，较大的流入道室间膈缺损，有共同房室瓣，简单的说就是两个房间各自的大门没有门框，只好凑成一个形状和功能都不完全的公用通道，还要发挥其二尖瓣和三尖瓣的功能。但是这个公用通道在二尖瓣、三尖瓣上的分配却不一定均匀，可能一侧大，一侧小。也可能是连接二尖瓣的腱索栓住右心室，更有可能右心室左心室根本就没有腱索。