脂肪肝引起肝功能异常的病因不同，采取的治疗措施不同，具体如下：

1、酒精性脂肪肝引起的肝功能异常，这时患者必须戒酒，然后治疗脂肪肝。目前没有药物对酒精性脂肪肝有治疗作用，除了维生素E有一定的治疗效果；

2、对于单纯肝功能不全，要改善肝功能指标，药物较多。

不管是酒精性的还是非酒精性的，如果是单纯以肝酶升高为主，可以用甘草酸制剂、水飞蓟宾葡甲胺片。对于有脂肪肝引起的黄疸升高，可以用注射用丁二磺酸腺苷蛋氨酸或者熊去氧胆酸片退黄。改善指标相对较简单，但是真正对病理的影响，即目前非酒精性脂肪肝的药物较少，多数药物还没有进入临床，比如改善胰岛素敏感性的药物盐酸吡格列酮片。对于酒精性脂肪肝肝功能不全引起的肝功能损伤、黄疸高，这时需要用激素治疗。