在临床上使用阿奇霉素用于治疗肺炎支原体感染，一般平均为1-2个疗程左右，尤其是对于比较轻度的初期感染的肺炎支原体导致的支气管炎，肺炎等，使用阿奇霉素1个疗程也就是2周左右的时间能够达到完全治愈。对于部分免疫力比较差的患者，很容易出现体内肺炎支原体清除不干净而再次复发，一般可以使用2个疗程，比如1个月左右的时间。

但是阿奇霉素的副作用主要是胃肠道刺激，表现为恶心、呕吐、腹泻，所以根据患者的反应来调整使用的疗程，如果副作用比较明显，还可以选择喹诺酮类的药物，比如左氧氟沙星。