足底的跖疣体积较大，较难去除，可以多次冷冻治疗，也可以尝试使用平阳霉素或者干扰素皮损根部注射治疗的方法，平阳霉素一般是10mg，用1%的普鲁卡因20ml稀释后在疣体根部注射，每次注射0.2-0.5ml，每周注射一次。而干扰素一般是使用200-300万单位加注射用水2ml，皮损根部注射，隔日注射一次。

对于上述方法仍不能去除者，还可以尝试给予干扰素每次100-300万单位皮下或者肌内注射，隔日一次或者每周3次，一般疗程需要4-6周，可以同时配合口服阿维A或者异维A酸。