先天性马蹄内翻足病因不是很清楚，从现代医学讲，有学者认为可能跟以下几个因素有关：

1、遗传，有报道说它是一个常染色体的显性遗传，我们在临床中观察，如果他的父辈、母辈有这个病，他往往发病的概率比其他的孩子平均高出将近30倍，这是遗传因素；

2、可能跟一些先天的因素有关，在胚胎的五周之内，基本上这个胎儿的脚是马蹄内翻状态，五周之后，马蹄内翻会慢慢转归到正常，当原始的胚质不足的时候，使得转归没法进行下去，也可能是引起先天性马蹄内翻的一个原因；

3、可能跟一些神经或者肌肉因素有关系；

4、这两年有报道说，可能胎儿在母体内的体位，当他的脚处于一些特殊位置的时候，引起局部肌肉缺血、缺氧，有些可能因为羊水偏少、宫腔体积变小，胎儿在宫腔内受到挤压，或受到相关压迫，引起马蹄内翻。

以上可能就是我们目前知道的马蹄内翻足的一些相关病因。