卵巢巧克力囊肿，腹腔镜手术在三甲医院需要17000块钱左右。由于医院的级别不同，收费标准也有所不同，比如二甲医院收费标准会有所降低。对于巧克力囊肿在相同级别的医院，但是所处的地区不同，如果做手术，收费标准也有所差别。

所以建议在手术之前最好去所去的医院咨询，了解具体收费情况。另外，对于巧克力囊肿腹腔镜手术，如果在术中发现有输卵管粘连需要剥离，或者有膀胱壁的粘连需要剥离，或者出现术中膀胱壁损伤的，收费标准可能又会有所增。