畸胎瘤做手术的时候需不需要切除卵巢由以下原因决定：

1、如果术中做冰冻病理切片发现有恶性程度，需要把卵巢同时切除，还需要切除子宫，切除输卵管等。

2、如果病人没有生育要求，进入了绝经期，建议同时把卵巢一起切除。

3、如果出现了广泛的粘连，没有办法剥离的情况下也需要切除卵巢。

4、当然如果畸胎瘤是良性的，又是生育年龄的女性，可以把畸胎瘤剥离出来，保留部分卵巢组织。