脑电图异常的原因是脑部发生了各种功能性或者器质性的损害。

功能性损害没有磁共振或者CT的影像学异常，由各种诱因所诱发，比如长时间不睡觉、熬夜，精神过度疲劳。器质性的原因比较好理解，比如各种类型的脑炎、脑血管病、脑寄生虫病、脑肿瘤，只要能够引起大脑发生损伤的疾病都有可能引起脑电图的异常。其中以能够引起大脑皮层病变的疾病最多见，比如脑炎或者脑膜炎，以病毒性脑炎和病毒性脑膜炎为主要代表。病毒性脑炎多累及颞叶、额叶，可能会出现精神障碍、癫痫发作，脑电图除了有慢波增多以外，还常常会有癫痫波。