梅毒晚期可以在小腿部位形成树胶样肿，鼻中隔骨质破坏，可以形成马鞍鼻。皮下可以形成纤维结节，呈对称性，大小不等，质硬，不活动。晚期梅毒主要表现为心血管梅毒以及神经梅毒，心血管梅毒一般主要是主动脉受到侵犯，可以发生主动脉瓣闭锁不全，引起梅毒性心脏病。

神经性梅毒可以表现为梅毒性脑膜炎、脑血管梅毒、脑膜树胶样肿、麻痹性痴呆等，患者可以出现颅内压增高、头痛、局部压迫症状，有的患者可以表现为感觉异常、共济失调等。