腮腺炎可能会导致男性不育，但较为少见。腮腺炎病毒可以侵入其他器官和系统，只有腮腺炎病毒侵入生殖系统，影响到睾丸时，才有可能会导致不育症发生，因为腮腺炎病毒可能会导致输精管道堵塞，产生炎症，多表现为单侧或双侧睾丸红肿、疼痛。少数的严重情况，可能会导致睾丸萎缩，使睾丸发生不可逆的病理性变化，造成少精子症甚至无精子症，从而影响生育。
腮腺炎病毒还可能侵入神经系统，引起脑炎、脑膜脑炎，侵入生殖系统也可以导致女性出现卵巢炎，不过比较少见。若患有腮腺炎，应及时就医，早期可应用抗病毒药物，如利巴韦林进行治疗。如果发热、胀痛，可以托高阴囊，进行局部冷敷，或在医生指导下服用镇痛药如布洛芬缓释胶囊。若腮腺炎很严重且合并其他并发症，如睾丸炎、脑膜炎、心肌炎，也可小剂量使用激素如地塞米松等进行治疗。